13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3386 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3386  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3356  hypothetical protein  87.84 
 
 		 74 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4094  hypothetical protein  89.19 
 
 		 74 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3851  hypothetical protein  83.78 
 
 		 107 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00188624  normal  0.510213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0037  hypothetical protein  63.16 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254213  decreased coverage  0.0000236921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5018  hypothetical protein  59.65 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1626  hypothetical protein  56.36 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2960  hypothetical protein  54.72 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2959  hypothetical protein  61.7 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0038  hypothetical protein  58.33 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229986  hitchhiker  0.0000929827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3368  hypothetical protein  47.69 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5027  hypothetical protein  45.83 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2911  hypothetical protein  48.78 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>