13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3356 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3356  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4094  hypothetical protein  95.95 
 
 		 74 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3851  hypothetical protein  89.19 
 
 		 107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00188624  normal  0.510213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3386  hypothetical protein  87.84 
 
 		 74 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0037  hypothetical protein  59.65 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254213  decreased coverage  0.0000236921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5018  hypothetical protein  61.4 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1626  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3368  hypothetical protein  47.69 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0038  hypothetical protein  54.17 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229986  hitchhiker  0.0000929827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2959  hypothetical protein  53.19 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2960  hypothetical protein  52.83 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5027  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2911  hypothetical protein  53.66 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>