58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0219 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.54328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5164  hypothetical protein  90 
 
 
102 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23504  normal  0.0982881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.88 
 
 
208 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5254  hypothetical protein  91.03 
 
 
112 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5306  hypothetical protein  86.25 
 
 
102 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  42.25 
 
 
223 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  44.38 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.66 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.78 
 
 
205 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.08 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  39.2 
 
 
213 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3359  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
188 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  30.6 
 
 
186 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.27 
 
 
195 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1777  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.03 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.6 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.6 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  31.64 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  26.35 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  26.35 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  30.77 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  29.14 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  25.57 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  26.35 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  28.09 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  26.35 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  26.35 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.86 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  25.75 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.4 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  25.15 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  25.99 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  25.84 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 
312 aa  64.3  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0579  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.73 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.735898  normal  0.0837341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  25.71 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  24.72 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  25.82 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  26.16 
 
 
184 aa  61.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
325 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.86 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  27.53 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  27.53 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  27.37 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.57 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.57 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.92 
 
 
318 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 
307 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.01 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0643  hypothetical protein  24.29 
 
 
318 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  26.32 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
329 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  26.47 
 
 
199 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.81 
 
 
313 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0461  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
310 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>