56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3925 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.76 
 
 
223 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  37.43 
 
 
185 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.21 
 
 
188 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  36.42 
 
 
186 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  35.84 
 
 
186 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  33.91 
 
 
188 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  35.29 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  34.68 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  28.96 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  31.43 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  33.91 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  29.21 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  36.75 
 
 
184 aa  94.7  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  32.77 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  31.89 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  29.57 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  33.91 
 
 
190 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  31.91 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  29.03 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  29.21 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  28.96 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
205 aa  89  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.44 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.48 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.48 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0579  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.05 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.735898  normal  0.0837341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.4 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  36 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.54328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  30.94 
 
 
223 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3359  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.02 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.12 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  29.82 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  29.82 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1777  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.09 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  27.84 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4195  hypothetical protein  27.33 
 
 
175 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.07 
 
 
307 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  24.18 
 
 
282 aa  55.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0461  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
310 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0643  hypothetical protein  26.82 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.38 
 
 
325 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.8 
 
 
329 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.57 
 
 
312 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  26.11 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0505  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.55 
 
 
330 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>