58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0423 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  66.85 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.81 
 
 		 188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3359  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.59 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.17 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  38.86 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  35.23 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.77 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.77 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.08 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.54328 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  31.84 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1777  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.1 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  31.75 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  31.75 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  31.22 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  31.22 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  30.69 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  30.69 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  35.39 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  32.22 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  32.22 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 325 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.51 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  31.43 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.02 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  30.86 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.62 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  30.86 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  30.86 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  29.38 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.79 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  29.71 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  29.71 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.65 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  29.84 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.37 
 
 		 329 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0579  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.735898  normal  0.0837341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  30.86 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.34 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  29.95 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  28.88 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  28.9 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0505  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 330 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4195  hypothetical protein  33.72 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5306  hypothetical protein  32.05 
 
 		 102 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5164  hypothetical protein  34.15 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23504  normal  0.0982881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0461  antibiotic biosynthesis monooxygenase  20.62 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5254  hypothetical protein  34.18 
 
 		 112 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>