58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3287 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 188 aa  376  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  72.99 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  73.53 
 
 		 189 aa  260  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  75 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  74.42 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  73.26 
 
 		 186 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  70.59 
 
 		 185 aa  257  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  73.84 
 
 		 186 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  72.67 
 
 		 190 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  64.25 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.78 
 
 		 202 aa  140  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  42.78 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  40.54 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 198 aa  99  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  27.27 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  27.43 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  26.86 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  31.03 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.48 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.48 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  34.13 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  34.13 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.69 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.1 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0579  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.35 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.735898  normal  0.0837341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  35.03 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.41 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4195  hypothetical protein  28.49 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.24 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.73 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.66 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3359  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  30.18 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 325 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  33.71 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.4 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.54328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  33.51 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.61 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1777  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.23 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0505  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.71 
 
 		 330 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  23.3 
 
 		 282 aa  52.4  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0643  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.32 
 
 		 318 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.14 
 
 		 329 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0461  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.04 
 
 		 310 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2455  hypothetical protein  40.28 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000416249  normal  0.293758 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.76 
 
 		 313 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>