19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1725 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  53.15 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0722  hypothetical protein  47.4 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2376  hypothetical protein  39.8 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00025955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  34.64 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3738  Fis family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00315119  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  26.04 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2820  RecT protein  24.5 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0195125  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1347  hypothetical protein  29.19 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342726  decreased coverage  0.0000821866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1187  hypothetical protein  25.95 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6975  hypothetical protein  25.11 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  25.95 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0967  hypothetical protein  29.41 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.621183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2290  gifsy-1 prophage protein  21.43 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2843  gifsy-1 prophage protein  21.43 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1045  gifsy-2 prophage RecT  21.43 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  hitchhiker  0.00000406128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  27.68 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  26.88 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2282  hypothetical protein  23.33 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.330275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>