16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0981 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  720    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2820  RecT protein  51.4 
 
 
295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0195125  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1045  gifsy-2 prophage RecT  39.74 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  hitchhiker  0.00000406128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2290  gifsy-1 prophage protein  40.6 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.116364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2843  gifsy-1 prophage protein  40.6 
 
 
369 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1347  hypothetical protein  33.54 
 
 
322 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342726  decreased coverage  0.0000821866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  42.86 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  37.01 
 
 
303 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  43.78 
 
 
334 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1187  hypothetical protein  41.14 
 
 
381 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6975  hypothetical protein  40.66 
 
 
341 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  29.24 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0722  hypothetical protein  27.45 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  26.04 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  25.7 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3738  Fis family transcriptional regulator  23.21 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00315119  normal  0.324352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>