19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4106 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  739    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  35.84 
 
 		 264 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0722  hypothetical protein  39.58 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  35.54 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2376  hypothetical protein  35.02 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00025955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6975  hypothetical protein  29.57 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3738  Fis family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00315119  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1347  hypothetical protein  32.93 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342726  decreased coverage  0.0000821866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  25.7 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  56.25 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  58.7 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1045  gifsy-2 prophage RecT  25.45 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  hitchhiker  0.00000406128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2290  gifsy-1 prophage protein  25.45 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2843  gifsy-1 prophage protein  25.45 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  26.9 
 
 		 303 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2820  RecT protein  23.91 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0195125  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1187  hypothetical protein  21.89 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2282  hypothetical protein  28.28 
 
 		 213 aa  50.4  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.330275 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0967  hypothetical protein  26.49 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.621183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>