15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3738 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3738  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00315119  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1347  hypothetical protein  41.97 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342726  decreased coverage  0.0000821866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3604  hypothetical protein  42.94 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.808419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  28.12 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2282  hypothetical protein  30.92 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.330275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  29.15 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  27.75 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0967  hypothetical protein  26.95 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.621183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0722  hypothetical protein  27.17 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  23.21 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  26.97 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  27.12 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2376  hypothetical protein  22.67 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00025955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1112  recombination protein bet  29.7 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.104209  normal  0.366414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  25.68 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>