15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2843 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1045  gifsy-2 prophage RecT  99.46 
 
 		 369 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  hitchhiker  0.00000406128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2843  gifsy-1 prophage protein  100 
 
 		 369 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2290  gifsy-1 prophage protein  99.73 
 
 		 369 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1077  gifsy-2 prophage RecT  98.1 
 
 		 158 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2820  RecT protein  50.45 
 
 		 295 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0195125  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  40.6 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1187  hypothetical protein  37.63 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  33.17 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  34.62 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  35.23 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6975  hypothetical protein  30.77 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0722  hypothetical protein  23.14 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  25.45 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  21.43 
 
 		 289 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  24.73 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>