11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0116 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0118  hypothetical protein  99.53 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0121  hypothetical protein  92.96 
 
 		 213 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209654  normal  0.54813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0080  hypothetical protein  76.28 
 
 		 210 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0286  hypothetical protein  74.64 
 
 		 216 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5257  hypothetical protein  73.68 
 
 		 216 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0141  hypothetical protein  68.42 
 
 		 213 aa  289  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0177  hypothetical protein  61.9 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01040  hypothetical protein  60.29 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00419663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0033  hypothetical protein  40.19 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0060  hypothetical protein  31.82 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>