11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5257 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5257  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0286  hypothetical protein  91.67 
 
 		 216 aa  400  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0116  hypothetical protein  73.68 
 
 		 213 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0118  hypothetical protein  73.21 
 
 		 213 aa  317  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0080  hypothetical protein  73.71 
 
 		 210 aa  314  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0121  hypothetical protein  70.81 
 
 		 213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209654  normal  0.54813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0141  hypothetical protein  63.68 
 
 		 213 aa  271  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0177  hypothetical protein  62.09 
 
 		 212 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01040  hypothetical protein  60.28 
 
 		 216 aa  258  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00419663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0033  hypothetical protein  39.13 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0060  hypothetical protein  34.52 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>