11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0033 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0033  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0141  hypothetical protein  41.55 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01040  hypothetical protein  41.35 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00419663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0118  hypothetical protein  40.19 
 
 		 213 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0080  hypothetical protein  41.04 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0116  hypothetical protein  40.19 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0177  hypothetical protein  40.38 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0121  hypothetical protein  39.62 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209654  normal  0.54813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0286  hypothetical protein  39.05 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5257  hypothetical protein  39.13 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0060  hypothetical protein  29.81 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>