11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01040 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01040  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00419663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0141  hypothetical protein  63.68 
 
 
213 aa  270  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0080  hypothetical protein  60.65 
 
 
210 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5257  hypothetical protein  60.28 
 
 
216 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0286  hypothetical protein  59.53 
 
 
216 aa  257  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0118  hypothetical protein  60.29 
 
 
213 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0116  hypothetical protein  60.29 
 
 
213 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0054252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0121  hypothetical protein  60.29 
 
 
213 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209654  normal  0.54813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0177  hypothetical protein  59.72 
 
 
212 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0033  hypothetical protein  41.35 
 
 
225 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0060  hypothetical protein  34.04 
 
 
228 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>