11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0080 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0116  hypothetical protein  76.28 
 
 		 213 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0118  hypothetical protein  75.81 
 
 		 213 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0121  hypothetical protein  73.49 
 
 		 213 aa  314  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209654  normal  0.54813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5257  hypothetical protein  73.71 
 
 		 216 aa  314  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0286  hypothetical protein  73.02 
 
 		 216 aa  314  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0141  hypothetical protein  66.35 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01040  hypothetical protein  60.65 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00419663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0177  hypothetical protein  62.09 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0033  hypothetical protein  41.04 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0060  hypothetical protein  36.97 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>