More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2901 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2901  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
332 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00119451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2729  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.94 
 
 
329 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.763747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2510  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.08 
 
 
322 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2118  methyltransferase  62.15 
 
 
327 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0047  methyltransferase  59.06 
 
 
328 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.509185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.75 
 
 
333 aa  362  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2530  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.56 
 
 
332 aa  348  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.67 
 
 
317 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  45.54 
 
 
314 aa  228  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.71 
 
 
313 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.68 
 
 
308 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.68 
 
 
310 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.48 
 
 
310 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.48 
 
 
310 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.37 
 
 
310 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.37 
 
 
310 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.37 
 
 
310 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
309 aa  222  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.57 
 
 
301 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.06 
 
 
310 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.06 
 
 
310 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.06 
 
 
310 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.06 
 
 
310 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.74 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.49 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.06 
 
 
310 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.99 
 
 
313 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.97 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.27 
 
 
311 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.51 
 
 
311 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.19 
 
 
308 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.06 
 
 
310 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0864  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.32 
 
 
313 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.247156  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.44 
 
 
311 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.21 
 
 
349 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.44 
 
 
311 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.63 
 
 
306 aa  216  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.68 
 
 
310 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.69 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.41 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.14 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.99 
 
 
318 aa  212  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.59 
 
 
349 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.09 
 
 
316 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.96 
 
 
305 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  42.59 
 
 
349 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.62 
 
 
311 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.2 
 
 
321 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.57 
 
 
316 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.12 
 
 
304 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.66 
 
 
318 aa  205  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.56 
 
 
307 aa  205  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.3 
 
 
313 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2869  methyltransferase  41.27 
 
 
315 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.77 
 
 
327 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.9 
 
 
312 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1255  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.36 
 
 
295 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00341421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.8 
 
 
313 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.12 
 
 
337 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.08 
 
 
303 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.18 
 
 
332 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.48 
 
 
315 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.31 
 
 
291 aa  202  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.06 
 
 
310 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.27 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.18 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.62 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  42.72 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.75 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.96 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.97 
 
 
355 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.12 
 
 
336 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.31 
 
 
313 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.33 
 
 
308 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.3 
 
 
520 aa  199  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2708  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.38 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00108828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.2 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.82 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.34 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.34 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.34 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.34 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.9 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.51 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.62 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.31 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.37 
 
 
332 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.41 
 
 
313 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.04 
 
 
313 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>