49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2182 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2182  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  87.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.931178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  58.54 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  60.98 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  48.78 
 
 		 128 aa  47.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  53.66 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  58.82 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  52.63 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  51.22 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  52.63 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  52.94 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  53.66 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  56.1 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  60.61 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  54.29 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  48.57 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  50 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  62.5 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  55.26 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  55.26 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  48.57 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  54.29 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  51.43 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  52.94 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  50 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  55.88 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  52.63 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  52.94 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  51.43 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  48.78 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  47.22 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  51.43 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  51.43 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  48.57 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  51.43 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  51.43 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  52.94 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  45.71 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  48.78 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  48.78 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  47.22 
 
 		 125 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  48.78 
 
 		 128 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  50 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  45.71 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  50 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  60 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  52.94 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  48.57 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  47.06 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>