286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0974 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0974  BolA family protein  100 
 
 
94 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  66.67 
 
 
94 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  44.94 
 
 
91 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  46.51 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  46.07 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  45.98 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  51.25 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  45.68 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  47.62 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  45.68 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  51.25 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  36.96 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  47.44 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  47.95 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  47.5 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  40.74 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  40.96 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  42.17 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  41.03 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  44.87 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  44.58 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  43.9 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  46.25 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  43.37 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  44.05 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  47.76 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  42.68 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  55.22 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  38.54 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  43.53 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  39.36 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  42.68 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  43.37 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  40.48 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  47.06 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  42.68 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  46.38 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  44.71 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  46.38 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  40.96 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  47.83 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  42.31 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  47.22 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  43.9 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  38.55 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  42.5 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  44.44 
 
 
87 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  45.68 
 
 
97 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  36.14 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  37.35 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  44.32 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1500  BolA family protein  53.09 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.029191  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  40.91 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  33.72 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  35 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  36 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2050  BolA family protein  42.31 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  35 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  35.37 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1459  BolA family protein  51.85 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102001  hitchhiker  0.00000045086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  37.35 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  32.67 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  39.76 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  54.32 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  43.18 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  39.24 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  43.18 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  41.33 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  43.18 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  37.04 
 
 
106 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  35.53 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  42.86 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  37.04 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  35.71 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  35.87 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2387  BolA-like protein  36.78 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  35.87 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  35.87 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  39.34 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  35.87 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  35.87 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  38.27 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  36.14 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  42.05 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  37.04 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  41.38 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  41.38 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  38.46 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  41.38 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  40.98 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  42.05 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  37.04 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  37.78 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>