31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1335 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1335  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000608654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  72.22 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  53.85 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  53.85 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  53.85 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  51.92 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  51.92 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  51.92 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  51.92 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  50.98 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  50.98 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  50.98 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  50.98 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  46.55 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 154 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  46.94 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  33.82 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  32.35 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  32.2 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  45.1 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  46.94 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>