19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1327 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1327  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.683901  hitchhiker  0.0000000000000530685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  96.97 
 
 		 457 aa  190  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  63.64 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  54.55 
 
 		 456 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  46.51 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  42.35 
 
 		 481 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  42.35 
 
 		 483 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  43.16 
 
 		 482 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  41.67 
 
 		 488 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  41.54 
 
 		 451 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  40 
 
 		 451 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  26.6 
 
 		 471 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  25.56 
 
 		 461 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 451 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25 
 
 		 469 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  33.33 
 
 		 453 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  32.56 
 
 		 450 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  33.72 
 
 		 450 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  40.91 
 
 		 462 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>