62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0772 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0772  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.748714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2114  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.37 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000109897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2340  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein  39.29 
 
 		 259 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0224374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2460  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  39.29 
 
 		 259 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1208  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  39.29 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  39.29 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2301  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein  39.29 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.325528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3370  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  39.29 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.881638  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1935  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  39.29 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2136  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  39.29 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0718934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2906  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.68 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.175953  normal  0.376466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.9 
 
 		 259 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.969048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1362  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.9 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1830  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.9 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211088  normal  0.622045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5213  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.9 
 
 		 260 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.18959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1900  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.71 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1935  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.71 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1920  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.07 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0828208  normal  0.871832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2280  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.07 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1912  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.71 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6167  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.71 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4391  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.35 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5787  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.35 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5073  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.35 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6760  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.51 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1868  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.94 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.232086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.77 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0385  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.14 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0379  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.32 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.71 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2264  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.31 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4234  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.47 
 
 		 278 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.201628  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5357  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.76 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7333  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.02 
 
 		 284 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.39139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2939  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.27 
 
 		 261 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1831  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.2 
 
 		 263 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1532  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.14 
 
 		 274 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.960664  normal  0.0352754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.8 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0975  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.73 
 
 		 263 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.23 
 
 		 305 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1501  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.33 
 
 		 265 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5054  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.93 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1744  putative isomerase rotamase signal peptide protein  33.75 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.608009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.33 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254902  hitchhiker  0.00000061145 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0873  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.86 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.399983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3083  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.1 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2585  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1392  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.51 
 
 		 264 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3298  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.95 
 
 		 261 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2399  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.89 
 
 		 261 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5445  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.35 
 
 		 245 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0154  putative PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.48 
 
 		 313 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.12 
 
 		 323 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  22.46 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1804  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.27 
 
 		 261 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1673  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 261 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.310312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2031  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 261 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4694  putative PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.69 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135101  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2951  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.71 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3181  putative signal peptide protein  34.12 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.2743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1764  putative exported isomerase  28.09 
 
 		 272 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_003296  RS04811  signal peptide protein  32.94 
 
 		 282 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.170909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>