52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0577 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0577  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1378  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.78 
 
 		 389 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.529834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0171  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.7 
 
 		 384 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0681  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.46 
 
 		 381 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3669  putative rubredoxin reductase  45.79 
 
 		 383 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.3 
 
 		 382 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5473  rubredoxin reductase  46.3 
 
 		 382 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6126  putative rubredoxin reductase  43.52 
 
 		 384 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.3 
 
 		 382 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.940486  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.37 
 
 		 382 aa  87  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312913  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70620  putative rubredoxin reductase  43.52 
 
 		 384 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.59 
 
 		 382 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5314  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 382 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5362  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 382 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3591  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.99 
 
 		 385 aa  80.5  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0159  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 382 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2315  putative rubredoxin reductase  43.4 
 
 		 378 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1816  rubredoxin-NAD(+) reductase  36.11 
 
 		 383 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0379  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.11 
 
 		 383 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  42.86 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3270  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.38 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.415771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0789  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.34 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4052  nitric oxide reductase  36.19 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3466  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.51 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  38.75 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0092  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.67 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3250  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.89 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4857  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.21 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.485222  normal  0.0812896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3183  nitric oxide reductase  33.33 
 
 		 377 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3027  nitric oxide reductase  34.62 
 
 		 377 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186803 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001302  nitric oxide reductase FlRd-NAD(+) reductase  33.33 
 
 		 382 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2992  nitric oxide reductase  34.62 
 
 		 377 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3043  nitric oxide reductase  34.62 
 
 		 377 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0659662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3150  nitric oxide reductase  34.62 
 
 		 377 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0327355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2834  nitric oxide reductase  30.48 
 
 		 377 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2961  nitric oxide reductase  34.62 
 
 		 377 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3961  nitric oxide reductase  30.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02526  hypothetical protein  30.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0978  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1001  nitric oxide reductase  30.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0544101  hitchhiker  0.00016497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2995  nitric oxide reductase  30.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2847  nitric oxide reductase  30.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02561  nitric oxide reductase  30.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3166  nitric oxide reductase  29.52 
 
 		 377 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1582  nitric oxide reductase  51.02 
 
 		 381 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  30.91 
 
 		 455 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3651  nitric oxide reductase  31.73 
 
 		 389 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2200  nitric oxide reductase  32.58 
 
 		 381 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1020  nitric oxide reductase  28.97 
 
 		 382 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.423073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3034  nitric oxide reductase  29.91 
 
 		 379 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.78 
 
 		 476 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0783  nitric oxide reductase  26.17 
 
 		 382 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>