17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4978 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008762  Pnap_4978  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5485  transcription regulator  65.31 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2391  putative transcription regulator with HTH domain  53.06 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31920  transcritional regulatior protein  53.06 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1533  transcription regulator  51.02 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4803  hypothetical protein  51.02 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0265  putative HTH-type transcriptional regulator ygjM  51.02 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0265  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.153911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3832  hypothetical protein  67.65 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672391  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2397  hypothetical protein  70.97 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3932  helix-turn-helix domain-containing protein  51.02 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5232  putative transcription regulator with HTH domain protein  42.86 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3482  hypothetical protein  40.82 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1148  hypothetical protein  43.75 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2845  hypothetical protein  58.82 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2129  transcription regulator containing HTH  52.27 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5739  hypothetical protein  46.51 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>