17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2738 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2738  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765019  normal  0.0159593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0496  hypothetical protein  33.43 
 
 
335 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0284  hypothetical protein  31.85 
 
 
329 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1168  hypothetical protein  35.51 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1648  hypothetical protein  35.51 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1568  hypothetical protein  33.98 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1549  hypothetical protein  35.31 
 
 
356 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0676157  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1623  hypothetical protein  37.27 
 
 
356 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4796  hypothetical protein  34.46 
 
 
356 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188588  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03700  hypothetical protein  34.02 
 
 
370 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0008  hypothetical protein  32.72 
 
 
343 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1590  hypothetical protein  37.91 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790201  normal  0.0437711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10855  hypothetical protein  34.27 
 
 
342 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.23283e-23  hitchhiker  0.00000000756843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23040  uncharacterized conserved protein (DUF2186)  30.68 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265776  normal  0.0531074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1828  hypothetical protein  22.99 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3722  hypothetical protein  26.58 
 
 
363 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04220  hypothetical protein  26.2 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>