17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03700 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03700  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  741    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1623  hypothetical protein  41.85 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475135 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1168  hypothetical protein  41.48 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1648  hypothetical protein  41.48 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1568  hypothetical protein  35.61 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0284  hypothetical protein  32.67 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1549  hypothetical protein  36.83 
 
 		 356 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0676157  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4796  hypothetical protein  34.2 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1590  hypothetical protein  39.34 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790201  normal  0.0437711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0496  hypothetical protein  29.65 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0008  hypothetical protein  27.9 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2738  hypothetical protein  34.02 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765019  normal  0.0159593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23040  uncharacterized conserved protein (DUF2186)  34.18 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265776  normal  0.0531074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10855  hypothetical protein  33.57 
 
 		 342 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.23283e-23  hitchhiker  0.00000000756843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1828  hypothetical protein  25.08 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0439  hypothetical protein  23.71 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>