16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23040  uncharacterized conserved protein (DUF2186)  100 
 
 
320 aa  632  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265776  normal  0.0531074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1549  hypothetical protein  35.13 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0676157  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4796  hypothetical protein  34.87 
 
 
356 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188588  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1568  hypothetical protein  35.71 
 
 
356 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1623  hypothetical protein  34.35 
 
 
356 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475135 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1168  hypothetical protein  34.36 
 
 
356 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1648  hypothetical protein  34.36 
 
 
356 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04220  hypothetical protein  35.31 
 
 
338 aa  106  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03700  hypothetical protein  34.18 
 
 
370 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1590  hypothetical protein  35.77 
 
 
373 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790201  normal  0.0437711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0284  hypothetical protein  28.46 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0496  hypothetical protein  28.97 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0008  hypothetical protein  25.3 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2738  hypothetical protein  30.68 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765019  normal  0.0159593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10855  hypothetical protein  27.55 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.23283e-23  hitchhiker  0.00000000756843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1828  hypothetical protein  23.11 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>