17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1568 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1549  hypothetical protein  97.19 
 
 		 356 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0676157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1168  hypothetical protein  87.36 
 
 		 356 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1648  hypothetical protein  87.36 
 
 		 356 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1623  hypothetical protein  87.36 
 
 		 356 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4796  hypothetical protein  81.46 
 
 		 356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1590  hypothetical protein  75.56 
 
 		 373 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790201  normal  0.0437711 
 
 
-
 
NC_003296  RS03700  hypothetical protein  35.61 
 
 		 370 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0496  hypothetical protein  39.08 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0284  hypothetical protein  30.62 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0008  hypothetical protein  30.25 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2738  hypothetical protein  33.98 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765019  normal  0.0159593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23040  uncharacterized conserved protein (DUF2186)  35.71 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265776  normal  0.0531074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1828  hypothetical protein  24.91 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10855  hypothetical protein  27.04 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.23283e-23  hitchhiker  0.00000000756843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04220  hypothetical protein  26.71 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0439  hypothetical protein  24.43 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>