17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1549 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0676157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1568  hypothetical protein  97.19 
 
 		 356 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1168  hypothetical protein  87.08 
 
 		 356 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1648  hypothetical protein  87.08 
 
 		 356 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1623  hypothetical protein  87.36 
 
 		 356 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4796  hypothetical protein  81.18 
 
 		 356 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1590  hypothetical protein  74.44 
 
 		 373 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790201  normal  0.0437711 
 
 
-
 
NC_003296  RS03700  hypothetical protein  36.83 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0496  hypothetical protein  39.08 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0008  hypothetical protein  29.43 
 
 		 343 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2738  hypothetical protein  35.53 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765019  normal  0.0159593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23040  uncharacterized conserved protein (DUF2186)  35.13 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265776  normal  0.0531074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1828  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10855  hypothetical protein  27.78 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.23283e-23  hitchhiker  0.00000000756843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04220  hypothetical protein  28.11 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0439  hypothetical protein  24.43 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>