16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1648 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1168  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1648  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1623  hypothetical protein  98.31 
 
 
356 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1568  hypothetical protein  87.36 
 
 
356 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1549  hypothetical protein  87.08 
 
 
356 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0676157  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4796  hypothetical protein  83.99 
 
 
356 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0188588  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1590  hypothetical protein  73.88 
 
 
373 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790201  normal  0.0437711 
 
 
-
 
NC_003296  RS03700  hypothetical protein  41.48 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0496  hypothetical protein  38.55 
 
 
335 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0284  hypothetical protein  32.44 
 
 
329 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0008  hypothetical protein  30.49 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2738  hypothetical protein  35.51 
 
 
357 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765019  normal  0.0159593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23040  uncharacterized conserved protein (DUF2186)  34.36 
 
 
320 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265776  normal  0.0531074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1828  hypothetical protein  24.09 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10855  hypothetical protein  27.31 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.23283e-23  hitchhiker  0.00000000756843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04220  hypothetical protein  25.89 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>