23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1165 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  0.18975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0028  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0042  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.773701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0042  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0045  hypothetical protein  37.08 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387192  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0056  hypothetical protein  37.21 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.656239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0059  hypothetical protein  37.21 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0209485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0056  hypothetical protein  37.21 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.793416  hitchhiker  0.00127332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  85.29 
 
 		 590 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0367  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4809  hypothetical protein  34.09 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.358293  normal  0.656053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0042  hypothetical protein  53.19 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384009  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2240  hypothetical protein  38.24 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3288  hypothetical protein  43.75 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  29.17 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  29.55 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  29.55 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  29.55 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  30.77 
 
 		 85 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>