33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3424 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3424  SCP-like extracellular  100 
 
 
138 aa  286  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.492654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  38.02 
 
 
338 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.77 
 
 
213 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  29.91 
 
 
328 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  28.1 
 
 
541 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  29.52 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  31.86 
 
 
245 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
209 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  27.97 
 
 
255 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  29.25 
 
 
347 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  29.73 
 
 
249 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  30.83 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  31.3 
 
 
317 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  34.62 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  27.93 
 
 
263 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  30.63 
 
 
276 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  27.93 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  27.93 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  27.93 
 
 
270 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  27.93 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  27.93 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  27.93 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  27.93 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  27.93 
 
 
270 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  30.95 
 
 
276 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.19 
 
 
455 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  27.03 
 
 
283 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  33.65 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  25.23 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
551 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  25 
 
 
244 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  25.37 
 
 
270 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  27.45 
 
 
335 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>