19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1577 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1577  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0375149  normal  0.121824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4114  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.69 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3117  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.14 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000341298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2651  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.69 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427614  normal  0.198754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2713  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.09 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2101  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.1 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0253  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.15 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.010369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3698  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.45 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1379  hypothetical protein  27.78 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00595304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.72 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1802  hypothetical protein  28.01 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09115  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.232777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1075  hypothetical protein  29.35 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.265361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3080  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.1 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6774  xylose isomerase domain-containing protein  23.74 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00915538  normal  0.10636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2487  hypothetical protein  24 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.797684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0913  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.408564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>