19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3117 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3117  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 253 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000341298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4114  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.41 
 
 		 272 aa  241  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2651  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.59 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427614  normal  0.198754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2101  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.1 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2713  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.17 
 
 		 313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3698  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.3 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0253  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.73 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.010369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.3 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1577  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.14 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0375149  normal  0.121824 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1802  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3080  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.6 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.6 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1075  hypothetical protein  38.01 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.265361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1379  hypothetical protein  31.72 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00595304 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09115  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.232777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2487  hypothetical protein  26.67 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.797684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.92 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6774  xylose isomerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00915538  normal  0.10636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0913  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.408564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>