15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1379 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1379  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00595304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  93.15 
 
 		 300 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3080  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.36 
 
 		 280 aa  322  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1802  hypothetical protein  50.18 
 
 		 282 aa  299  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1075  hypothetical protein  36.13 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.265361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0253  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.71 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.010369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2651  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.43 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427614  normal  0.198754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2713  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3698  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2101  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.46 
 
 		 270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.97 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4114  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.62 
 
 		 272 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1577  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.78 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0375149  normal  0.121824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3117  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.72 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000341298  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09115  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.232777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>