20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1316 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1316  hypothetical protein  100 
 
 
712 aa  1476    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1618  hypothetical protein  25.42 
 
 
714 aa  115  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140855  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3877  hypothetical protein  23.62 
 
 
841 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.454403  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1310  hypothetical protein  25.64 
 
 
735 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1718  hypothetical protein  26.08 
 
 
903 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896038  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1755  hypothetical protein  23.03 
 
 
975 aa  95.5  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000113788  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0527  hypothetical protein  26.07 
 
 
981 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.23 
 
 
1362 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4845  hypothetical protein  24.14 
 
 
829 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  hitchhiker  0.00200292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1369  hypothetical protein  22.22 
 
 
868 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4344  hypothetical protein  22.57 
 
 
966 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0662196  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06210  conserved hypothetical protein  25.41 
 
 
1083 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0766875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1833  hypothetical protein  24.08 
 
 
953 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0350  hypothetical protein  22.58 
 
 
1022 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02750  hypothetical protein  23.3 
 
 
885 aa  70.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2299  hypothetical protein  30.34 
 
 
982 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61283  predicted protein  21.03 
 
 
997 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0585405  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1622  hypothetical protein  27.04 
 
 
970 aa  60.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1578  hypothetical protein  25.1 
 
 
250 aa  54.3  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3905  hypothetical protein  24.71 
 
 
965 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>