22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1310 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1310  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1530    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2299  hypothetical protein  25.29 
 
 
982 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3905  hypothetical protein  26.73 
 
 
965 aa  168  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1369  hypothetical protein  24.54 
 
 
868 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0527  hypothetical protein  25.33 
 
 
981 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4344  hypothetical protein  26.15 
 
 
966 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0662196  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3877  hypothetical protein  25.32 
 
 
841 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.454403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1718  hypothetical protein  26.2 
 
 
903 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896038  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4845  hypothetical protein  25.16 
 
 
829 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  hitchhiker  0.00200292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.62 
 
 
1362 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1755  hypothetical protein  22.47 
 
 
975 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000113788  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02750  hypothetical protein  24.39 
 
 
885 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1833  hypothetical protein  27.23 
 
 
953 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1622  hypothetical protein  25.06 
 
 
970 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61283  predicted protein  24.3 
 
 
997 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0585405  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06210  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 
1083 aa  105  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0766875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1316  hypothetical protein  25.64 
 
 
712 aa  101  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1618  hypothetical protein  25.68 
 
 
714 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0350  hypothetical protein  22.69 
 
 
1022 aa  99.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09329  conserved hypothetical protein  23.36 
 
 
866 aa  78.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1577  hypothetical protein  26.98 
 
 
307 aa  63.9  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1578  hypothetical protein  24.9 
 
 
250 aa  58.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>