21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1578 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1718  hypothetical protein  54 
 
 		 903 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3877  hypothetical protein  42.73 
 
 		 841 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.454403  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4344  hypothetical protein  36.51 
 
 		 966 aa  164  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0662196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4845  hypothetical protein  38.52 
 
 		 829 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  hitchhiker  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0527  hypothetical protein  36.07 
 
 		 981 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1755  hypothetical protein  35.81 
 
 		 975 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000113788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.13 
 
 		 1362 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02750  hypothetical protein  36.21 
 
 		 885 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0350  hypothetical protein  46.62 
 
 		 1022 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1833  hypothetical protein  45.33 
 
 		 953 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1622  hypothetical protein  36.93 
 
 		 970 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61283  predicted protein  35.47 
 
 		 997 aa  143  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0585405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06210  conserved hypothetical protein  33.47 
 
 		 1083 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0766875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1369  hypothetical protein  39.55 
 
 		 868 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2299  hypothetical protein  35.24 
 
 		 982 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3905  hypothetical protein  34.15 
 
 		 965 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164927  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09329  conserved hypothetical protein  36.89 
 
 		 866 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1310  hypothetical protein  24.9 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1316  hypothetical protein  25.1 
 
 		 712 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 714 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>