23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4845 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1718  hypothetical protein  53.05 
 
 		 903 aa  910    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1755  hypothetical protein  50.73 
 
 		 975 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000113788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0527  hypothetical protein  50.65 
 
 		 981 aa  664    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4845  hypothetical protein  100 
 
 		 829 aa  1721    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  hitchhiker  0.00200292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02750  hypothetical protein  43.01 
 
 		 885 aa  683    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3877  hypothetical protein  46.79 
 
 		 841 aa  803    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.454403  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4344  hypothetical protein  54.27 
 
 		 966 aa  725    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0662196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1833  hypothetical protein  52.82 
 
 		 953 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.69 
 
 		 1362 aa  601  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61283  predicted protein  41.09 
 
 		 997 aa  555  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0585405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0350  hypothetical protein  42.3 
 
 		 1022 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1369  hypothetical protein  35.55 
 
 		 868 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06210  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 		 1083 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0766875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1622  hypothetical protein  36.12 
 
 		 970 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3905  hypothetical protein  34.37 
 
 		 965 aa  376  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164927  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2299  hypothetical protein  32.63 
 
 		 982 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09329  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 		 866 aa  330  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1577  hypothetical protein  45.48 
 
 		 307 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1578  hypothetical protein  38.52 
 
 		 250 aa  162  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1310  hypothetical protein  25.16 
 
 		 735 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1618  hypothetical protein  25.37 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1316  hypothetical protein  23.45 
 
 		 712 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1576  hypothetical protein  28.14 
 
 		 200 aa  90.5  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.863042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>