23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02750 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1718  hypothetical protein  41.81 
 
 
903 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896038  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4845  hypothetical protein  42.89 
 
 
829 aa  677    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  hitchhiker  0.00200292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02750  hypothetical protein  100 
 
 
885 aa  1806    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3877  hypothetical protein  40.57 
 
 
841 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.454403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1833  hypothetical protein  50.08 
 
 
953 aa  623  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1755  hypothetical protein  44.3 
 
 
975 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000113788  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0527  hypothetical protein  42.88 
 
 
981 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4344  hypothetical protein  46.72 
 
 
966 aa  595  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0662196  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.52 
 
 
1362 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0350  hypothetical protein  40.6 
 
 
1022 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61283  predicted protein  39.07 
 
 
997 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0585405  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1369  hypothetical protein  34.71 
 
 
868 aa  445  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1622  hypothetical protein  36.48 
 
 
970 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3905  hypothetical protein  33.08 
 
 
965 aa  365  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164927  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06210  conserved hypothetical protein  33.38 
 
 
1083 aa  340  9e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0766875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2299  hypothetical protein  35.17 
 
 
982 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1577  hypothetical protein  46.86 
 
 
307 aa  300  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09329  conserved hypothetical protein  33.26 
 
 
866 aa  267  7e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1578  hypothetical protein  36.21 
 
 
250 aa  154  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1310  hypothetical protein  24.04 
 
 
735 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1618  hypothetical protein  25.89 
 
 
714 aa  102  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1316  hypothetical protein  23.3 
 
 
712 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1576  hypothetical protein  23.72 
 
 
200 aa  62.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.863042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>