17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4717 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  75.58 
 
 		 86 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  72.09 
 
 		 86 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  67.44 
 
 		 86 aa  120  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  67.44 
 
 		 86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  60.92 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  59.77 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  42.03 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  34.33 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04607  hypothetical protein  35.94 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1715  hypothetical protein  32.88 
 
 		 102 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.825989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1760  hypothetical protein  39.06 
 
 		 105 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0207177  normal  0.0104849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  33.82 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2888  hypothetical protein  39.06 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.663945  hitchhiker  0.000042326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>