14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0785 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  62.79 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  60.47 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  65.52 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  64.37 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  40.91 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  40.85 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2697  hypothetical protein  39.06 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  32.84 
 
 		 87 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>