15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4431 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  88.37 
 
 		 86 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  75.58 
 
 		 86 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  70.93 
 
 		 86 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  62.79 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  60.47 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  63.22 
 
 		 87 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  63.22 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  40.48 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2697  hypothetical protein  45.31 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  39.39 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  42.25 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1715  hypothetical protein  36.99 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.825989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  29.85 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>