16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1068 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  44.93 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  42.03 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  46.34 
 
 		 87 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  37.84 
 
 		 74 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  40.48 
 
 		 86 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  45.12 
 
 		 87 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04607  hypothetical protein  36.51 
 
 		 78 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  32.84 
 
 		 87 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0974  hypothetical protein  40.91 
 
 		 104 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2431  hypothetical protein  30.59 
 
 		 104 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.642772  normal  0.0866494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2392  hypothetical protein  27.27 
 
 		 271 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>