14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0683 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  167  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04607  hypothetical protein  58.82 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  38.81 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  34.33 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  37.31 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  34.62 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  32.84 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  31.34 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1760  hypothetical protein  36.67 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0207177  normal  0.0104849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3311  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472394  normal  0.587923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  29.85 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  29.85 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2431  hypothetical protein  30.68 
 
 		 104 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.642772  normal  0.0866494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  32.84 
 
 		 86 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>