15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5282 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  98.85 
 
 
87 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  65.52 
 
 
86 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  64.37 
 
 
86 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  63.22 
 
 
86 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  60.92 
 
 
86 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  59.77 
 
 
86 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  58.62 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  59.77 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  45.12 
 
 
264 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  42.65 
 
 
74 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1521  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  37.14 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1715  hypothetical protein  35.16 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.825989  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0974  hypothetical protein  36.99 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.555742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>