64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2888 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  213  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.663945  hitchhiker  0.000042326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1760  hypothetical protein  87.62 
 
 		 105 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0207177  normal  0.0104849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2333  hypothetical protein  79.61 
 
 		 105 aa  174  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.101218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2480  hypothetical protein  74.29 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1451  hypothetical protein  74.29 
 
 		 105 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185843  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3109  hypothetical protein  71.43 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2803  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000126171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1574  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161708  hitchhiker  0.0000000681184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2783  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2878  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00334069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1386  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136408  hitchhiker  0.000000182835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1439  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0106518  hitchhiker  0.00000448294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2189  hypothetical protein  73.33 
 
 		 105 aa  160  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612921  decreased coverage  0.00273146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  70.48 
 
 		 105 aa  159  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2697  hypothetical protein  62.86 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1405  hypothetical protein  65.71 
 
 		 105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0611386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2431  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.642772  normal  0.0866494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0904  hypothetical protein  30.93 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1013  hypothetical protein  31 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.725649  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2971  hypothetical protein  31 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.319072  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2228  hypothetical protein  32.98 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.857457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3504  Zn-ribbon like domain-containing protein  37.04 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.887802 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0239737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1667  hypothetical protein  32.98 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5171  hypothetical protein  40.21 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4671  hypothetical protein  32.63 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1232  hypothetical protein  33.67 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1075  hypothetical protein  30.85 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0596  hypothetical protein  30.85 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1034  hypothetical protein  30.85 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4189  hypothetical protein  30.85 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0810  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.221696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003944  hypothetical protein  36.14 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2577  hypothetical protein  27.96 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3050  hypothetical protein  32.29 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0881  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.605783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2967  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0955  hypothetical protein  30.85 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.120553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01578  hypothetical protein  29 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1521  hypothetical protein  31 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3381  hypothetical protein  33.66 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2911  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2851  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0911  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2538  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0939  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.013533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0395  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.013553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2961  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0236  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4663  hypothetical protein  34.34 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.923088  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0951  hypothetical protein  29.79 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3682  hypothetical protein  33.68 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03295  uncharacterized conserved protein containing predicted Zn-ribbon like domain  28.43 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.556197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1715  hypothetical protein  29.59 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.825989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1934  hypothetical protein  31.52 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  hitchhiker  0.00191863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3915  hypothetical protein  32.26 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.161933  hitchhiker  0.00330131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0974  hypothetical protein  30.19 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3378  hypothetical protein  29.47 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4028  hypothetical protein  29.47 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  39.06 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3715  Zn-ribbon like domain-containing protein  28.87 
 
 		 103 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>