28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2366 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2366  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  236  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0934629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0729  XRE family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495438  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3665  XRE family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40210  hypothetical protein  68.83 
 
 		 184 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3407  hypothetical protein  67.53 
 
 		 184 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5335  XRE family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 188 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0324234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4951  XRE family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 188 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0587865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3417  XRE family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 188 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913782  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4893  XRE family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 185 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4376  XRE family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 185 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3723  hypothetical protein  59.65 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00883252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3527  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4740  GCN5-related N-acetyltransferase  58.54 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0069125  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  58.54 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  60.53 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55117  hypothetical protein  48.78 
 
 		 305 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.98087e-16 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3031  GCN5-related N-acetyltransferase  55.26 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2731  GCN5-related N-acetyltransferase  55.26 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1246  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_004310  BR1551  acetyltransferase  56.41 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394216  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1499  acetyltransferase  56.41 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  55.88 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2181  acetyltransferase  57.58 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.915726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4800  acetyltransferase  50 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  60.61 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0356  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  52.5 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  51.35 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  0.582015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>