16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0356 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0356  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0355  XRE family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0357  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0206  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2578  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3407  hypothetical protein  63.64 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40210  hypothetical protein  62.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  48.78 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  48.98 
 
 		 610 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2366  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0934629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0729  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 188 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495438  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5335  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0324234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3417  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913782  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4951  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0587865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>