13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3407 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3407  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  360  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40210  hypothetical protein  88.04 
 
 		 184 aa  321  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.244823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3417  XRE family transcriptional regulator  66.3 
 
 		 188 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913782  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4951  XRE family transcriptional regulator  66.3 
 
 		 188 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0587865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4893  XRE family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 185 aa  236  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5335  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0324234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0729  XRE family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 188 aa  234  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495438  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3665  XRE family transcriptional regulator  64.64 
 
 		 185 aa  234  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4376  XRE family transcriptional regulator  64.48 
 
 		 185 aa  233  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3723  hypothetical protein  64.24 
 
 		 168 aa  224  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00883252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3527  transcriptional regulator, XRE family  47.13 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2366  XRE family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 117 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0934629 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0356  XRE family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>